又称酶催反应。酶促反应中被酶作用的物质称为底物，经过反应生成的物质称为产物。和其他催化剂一样，酶在反应前后其性质和数量都不改变。一般认为在酶促反应中，酶(E)先与底物(S)结合形成酶-底物中间络合物(ES)，然后中间络合物再分解，生成产物(P)并释放出酶：
通常以反应产物的生成速度代表整个酶催化的反应速度，而产物的生成速度决定于中间络合物的浓度，因此整个酶促反应的速度决定于中间络合物的浓度。
在海洋有机化学中，酶促反应被用于测定海水中某些有机化合物例如葡萄糖、腺苷三磷酸、尿素等的浓度。叫做酶促法(enzymatic method)。酶促法灵敏度很高，并具有选择性，水样一般不须经过预浓缩即可直接测定。酶促反应也用于测定海水和沉积物中的酶活力，在试样中加入一已知的底物，然后测定酶促反应的产物。