《海洋与湖沼》学报(1981年由季刊改为双月刊) 于1957年11月，由曾呈奎与赫崇本、刘建康、刘瑞玉等创办于青岛，由中国海洋湖沼学会主办，中国科学院海洋研究所承办。1961年和1967～1977年先后停办两次，1978年复刊，迄今共出版29卷148期。编委会第一任主编为曾呈奎; 第二任主编为刘瑞玉; 现任主编为秦蕴珊。
《海洋与湖沼》学报自1957年创刊以来，始终坚持以基础研究、应用基础研究为主，重视应用研究和开发研究成果，所选登的论文主要涉及水圈范围内的物理学、化学、地质学、环境学、生物学等学科。多年来刊物以学术水平高而受到国内外的关注，在国际上被SA (英)、BA (美)、OA (美)、MOFR(美)、JICS (日)、РЖ(俄) 等著名检索刊物、数据库等检索引用; 还被许多外国大学和情报机构直接或间接检索。在国内省部级以上刊物评比中均获奖，刊物的引文频次逐年递增，1995年名列第40位，居本学科首位。《海洋与湖沼》学报的成就还体现在：①培养了大批优秀科技人才，促进了国内外学术交流。许多科技人员由于在《海洋与湖沼》学报发表论文，而被世界有名高校及科研所等邀请合作研究。如美国麻省理工学院，加拿大贝德福海洋研究所(Bedford Instituteof Oceanography，Canada)等。还有的不仅获得了中国国家优秀青年基金奖，还获得了国际基金奖，如中国海洋大学宋微波获得国际原生动物学会Wilhelm和Ilse Foissner基金奖。该奖自立以来，他是亚洲第一位获此奖的学者。②为国家经济建设做出了重大贡献。《海洋与湖沼》近年来所发表的论文具有重大潜在经济效益的约占1/3，如涉及国家重大建设工程中的引滦工程、海上石油工程、长江三峡工程，还有赤潮治理、湖泊污染防治及鱼虾贝藻养殖等方面的文章。扇贝大王张福绥的 “扇贝人工养殖”推广于社会，取得了巨大的经济效益，使扇贝这一昔日海珍品成为百姓的便肴。他的科研成果不但获得了1989年国家科技进步一等奖，还获得1995年陈嘉庚农业奖。③许多科研人员的重大课题基金申请、博士生毕业的合格审查等都是通过在《海洋与湖沼》学报发表论文才得以实现的。因此，刊物得到有关专家的高度评价：“《海洋与湖沼》学报是深受国内海洋湖泊科技工作者信赖的权威性学术刊物之一，是国家建设、人才成长、国际学术交流和海洋湖沼工作者不可或缺的重要工具，也是国际上公认的中国海洋与湖沼学科的代表性刊物之一。”