在黄鳝人工养殖或运输过程中，由于操作不当往往容易发生一些非寄生性病害。这类病害发病急、危害大、死亡率高，会给黄鳝养殖生产者或销售者造成极大的经济损失。因此，无论是在高密度养殖期间，还是在运输、销售过程中，都要严格按操作要求进行，避免此类事故的发生。
1.黄鳝感冒病
(1)症状：黄鳝的皮肤失去原有的光泽，体表大量分泌黏液，随着时间的持续，黄鳝陆续出现死亡现象。如果水温急剧下降或升高，可能会造成黄鳝大批死亡，甚至全部黄鳝死亡。
(2)病因：造成黄鳝感冒的原因主要有以下几种：一是养殖期间天气突然变化，如炎夏的中午突降暴雨，使池水水温骤然变化;二是池塘换水时水温不一致且一次换水量过大，使池塘水温变化幅度过大;三是运输途中换水时，换水过多，并且水温温差过大;四是黄鳝放养时，运输水温与池塘水温温差过大，鳝种没有经过过渡直接放养，使黄鳝在短时间内不适应而造成感冒。
(3)防治方法：鳝池在换新水时，每次不超过全池水体的1/3，并且先排后注。不宜采用水温过低的井水直接养黄鳝，井水要经过蓄水池曝晒增温，使水温与鳝池水温接近。暴雨前加深鳝池水位，并且疏通排水设施，便于过多的水及时排除。黄鳝在运输途中换水时宜勤换少换，换水温差不得超过2℃。黄鳝苗种运输到池边时，不要急于投放，先对鱼种进行温度过渡和消毒，待水温与池水温度基本一致时再放养。
2.黄鳝发烧病
(1)症状：病鳝极度焦躁不安，相互缠绕，底层黄鳝缠绕成团，因无法呼吸而致死。发烧病往往造成黄鳝大批死亡，死亡率甚至达90%以上。
(2)病因：一是鳝池放养密度大，局部水体内黄鳝数量多，再加上投喂饵料，增加了水体有机物承载的负担，水体不堪重负，造成黄鳝发烧;二是池底清理不完全，池塘消毒不彻底，使有机质大量积存于池底;三是黄鳝贮运前没有经过蓄养排便，再加上贮运密度大，没能及时换水，使贮运容器成为黄鳝发烧的发酵罐。
(3)防治方法：黄鳝的放养密度一定要适当，要根据水源的供应情况、池塘的养殖条件、生产管理水平等因素确定放养密度。黄鳝放养前对池塘进行清整，一定要用生石灰进行消毒。夏季在鳝池内适当种植一些水生植物，如水花生、水浮莲等，便于黄鳝隐藏及水体遮阴等。根据水质状况经常换注新水，改善水质。及时清除残饵粪便，减少有机污染。混养适量泥鳅，通过泥鳅的窜游减少黄鳝的缠绕。黄鳝运输前先蓄养排便，运输密度要合适，运输途中常换水。
3.黄鳝萎瘪病
(1)症状：病鳝身体明显消瘦、干瘪，头大身细，尾如线状，脊背薄，体色发黑。病鱼沿池边迟钝地单独游动，严重的丧失摄食能力，不久即死亡。
(2)病因：一是饵料的投喂量不足，个体小、体质弱的黄鳝抢食能力差，摄食不到饵料，造成鳝体萎瘪;二是放养密度大，一些弱小的个体生长慢，逐渐被淘汰而萎瘪;三是黄鳝越冬前积累的营养物质不足，越冬期间消耗大，春季时出现萎瘪病;四是饵料营养成分不足，尤其是动物性蛋白不足，造成黄鳝生长缓慢而萎瘪。
(3)防治方法：饵料投喂要充足，按“四定”要求投喂饵料。增加动物性蛋白的比例，如小鱼虾、动物内脏、蚯蚓、蝇蛆、黄粉虫等。适当控制黄鳝的放养密度，不宜投放过密。严格进行分级饲养，按照不同的规格分别放养。越冬前进行强化培育，保证黄鳝吃饱吃好，发育正常。
4.黄鳝中毒症
(1)症状：中毒的黄鳝因有毒物质的种类不同而表现不同的症状，一般在开始阶段表现为急剧游动，然后逐渐麻痹，行动迟缓，体色渐渐变成黑色，直至衰竭而亡。
(2)病因：一是硫化氢中毒，病鱼鳃变为紫红色，鳃盖和胸鳍张开，活动力逐渐衰弱，死亡鱼体失去光泽;二是酚中毒，鱼体表现为兴奋、窜游、颤抖，游动逐渐减弱，呈昏迷状态，直至死亡，死亡鱼体煤油味较浓;三是农药中毒，包括有机氯、有机磷、有机砷、有机汞、有机硫等农药，黄鳝农药中毒后初期表现狂游等急剧游动，鱼体逐渐失去平衡，直至死亡;四是工业废水中毒，包括苯类衍生物、酸、碱、重金属等中毒，轻者造成黄鳝减少摄食，影响生长，重者鱼体活动衰弱，直至死亡。
(3)防治方法：工业废水必须进行处理后才能用于渔业生产。生活污水也要进行处理，经过蓄污池的沉淀净化后使用。禁止农药污水流入，不得使用池塘水洗刷农药器具。禁止使用霉变饵料投喂黄鳝。饵料添加剂必须符合有关规定，并且剂量在允许使用的范围内。池塘水质须及时更新处理，避免产生有害物质，如硫化氢、亚硝酸盐等，保证净水养鱼。
5.黄鳝昏迷症
(1)症状：黄鳝因水温过高而长时间昏迷。此病大多发生于炎热的夏季，由于养殖池塘水位较浅，池水温度上升较高，黄鳝适应不了这种环境，致使长时间呈昏迷状态，挽救不及时就会造成黄鳝大量死亡。
(2)病因：一是池水水位较浅，水温上升快;二是较长时间保持高温状态，超出了黄鳝的适应范围，使黄鳝难以适应。
(3)防治方法：进入夏季对黄鳝池遮阴，如种植水花生等水生植物。高温季节经常换水，保持池水清新凉爽。夏季保持较高水位，避免阳光晒透水体，致使水体长久保持高温状态。饵料中添加维生素C等添加剂，增强鱼体的抗应激能力。