由于鱼体皮肤能分泌黏液，鱼体内又有一定的免疫力，细菌通常难以侵入。但当水体中鱼类密度增加、水质条件恶化、饲养管理不当、鱼体有损伤、鱼类抵抗力降低时，细菌性鱼病也常发生和流行，造成鱼类大量死亡。
常见的细菌性疾病有烂鳃病、细菌性败血症等，致病菌多为条件致病菌，细菌性疾病的发生常与寄生虫寄生、水质或底质不良、机械损伤等有关。细菌性疾病常表现出较为明显的临床症状，死亡量大或不间断的持续死亡是其重要的特点，不论是在季节交替时还是在连续阴雨天气或高温养殖期都会经常发生。寄生虫病的防治与维护良好的水质和底质环境、提高抗病力是防治该类疾病的重点。