(1) 综合利用 对于食品加工过程中产生的废弃物，首先应考虑综合利用。
① 加工果酱、果菜汁：残次果可用于果酱、果泥的加工，如菠萝、苹果等。其次，部分果芯、果皮亦可用于果菜汁的加工，如芦笋皮、根可以压汁加工，菠萝皮、芯亦可用于压汁加工。菜汁、果汁经调配后可加工成饮料。
② 加工骨泥： 肉、禽类骨头，碎肉等可食部分可通过骨、肉分离机及胶体磨加工成骨泥返回至产品(如午餐肉)或另外调配成其他泥状食品。
③ 生产饲料添加剂： 啤酒发酵产生的废酵母泥，可全部回收采用滚筒干燥处理，制成干酵母粉用作为饲料添加剂。
④ 提取有效成分： 从菠萝皮提取蛋白酶，从橘皮、柚皮等提油后加工果胶(详见本书第二卷《食品过程工程》中14.综合利用)。从番茄皮提取红色素。
(2) 生产饲料 对于生产规模较大而又有较多废弃物产生时，可先经充分综合利用后再加工成饲料。在我国，比较成熟的有鱼粉生产(详见本书第二卷《食品过程工程》中14.综合利用)，也有将麦糟干燥成颗粒粕。在国外常见的还有将菠萝皮、橘皮加工成颗粒粕。并可利用皮渣烘干时产生的二次蒸汽用于果汁的浓缩。
对于生产规模较小而废弃物量又不是最大的，或上述废弃物无干燥条件时，可采用堆场自然晒干的方法，或直接将湿渣等废弃物运往农村作为饲养家畜饲料。
(3) 生产肥料 食品工厂大部分废弃物为含丰富蛋白质、糖分的有机物质。对于无综合利用价值，又不能加工饲料的废弃物，可通过发酵法生产有机肥料，用于农作物。
(4) 煤灰渣利用 可用作建筑材料及铺筑公路。