1.外部特征
大菱鲆分类上属于鲽形目、鲆科、菱属，身体扁平近似圆形，双眼位于左侧。有眼的一侧(背面)呈青褐色，有点状黑色素及少量皮棘，会随环境变化而变更体色的深浅。无眼侧白色，光滑无鳞。口大，吻短，口裂前上位，上下颌对称，下颌骨较上颌骨稍，向前延伸，头长为颌长的2.0～2.3倍，头部占体表面积的8%左右。颌齿呈带状排列、弯曲细小，左右侧同样发达，犁骨具齿。背鳍、臀鳍、尾鳍均发达，无硬棘而软鳍条较长，鳍条间有鳍膜相连，背鳍前端鳍条不分支，臀鳍、尾鳍鳍条末端分支。腹鳍小，分离与臀鳍前方，鳍条弯曲，无眼侧的第1鳍条与有眼侧的第2或第3枚鳍条相对。胸鳍不发达，有眼侧稍长，中部的鳍条分支。有眼侧和无眼侧侧线同样发达，在胸鳍上方有一弓状弯曲部，具颞上支。
2.内部结构
大菱鲆的内部结构，主要包括消化系统、呼吸系统、循环系统、排泄系统、生殖系统、肌肉系统、骨骼系统、神经系统、内分泌系统和感觉器官等。这里主要介绍消化系统和生殖系统。
腹腔的前方的内脏团主体是消化道和消化腺，约占体重的1/10。消化道由口腔、食道、胃、肠直肠和肛门组成。食道呈喇叭状，前端与咽喉相连，食道后端变窄连接于胃部。胃呈弯曲的纺锤体囊状，中间膨大，贲门部和幽门部两端收缩变小，幽门部有2个幽门盲囊。幽门后接肠道，肠道细长弯曲、回转，末端与直肠相连。直肠短而粗，末端与肛门相连。肛门开口于腹部前方、两腹鳍之间。消化腺主要有肝脏、胆囊和脾脏。肝脏大而明显，呈棕红色覆盖于内脏团的前半部。肝脏有上下两叶，上叶比下叶大。胆囊位于肝脏上叶腹面，呈绿色、椭圆形。脾脏位于肝脏两叶与直肠之间，呈深红色。
腹腔的后部主要是性腺，大菱鲆雌雄异体。雄鱼精巢分上下两叶，呈乳白色三角体，每叶中间有一条纵沟。两叶的纵沟前端相通，共同开口于排尿生殖孔。精巢后端圆钝游离，通过韧带连接于腹腔。雌鱼卵巢也分上下两叶，分列于脊椎骨两侧，呈戟状。两叶前端相连处形成排卵腔，共同开口于肛门，后端延长至腹腔末端。卵巢呈黄色，卵巢上分布有许多血管，成熟时十分饱满，隆起充满腹腔后部，腹部体表明显胀起。