地矿部海洋地质研究所，是一所部属的海洋地质专业研究机构。1964年开始建于南京，牟闵任副所长，1970年撤所，迁广东省湛江市改为国家地质总局第二海洋地质调查大队，1979年重建于青岛，业治铮院士任所长，1984年何起祥任所长，1991年刘守全(法人代表)任副所长至今。地矿部第四纪地质研究中心、地矿部海洋沉积开放研究实验室、地矿部海洋地质实验测试中心和地矿部青岛珠宝玉石质量监督检验中心均设在该所。
1997年在职员工219人，各类科技人员170人，其中具有高级职称研究人员76人(研究员21人)，博士8人，硕士33人，正在攻读博士学位的4人，硕士学位的2人，有11人获得国家政府特殊津贴。设有“海洋第四纪地质”、“石油地质”、“海洋矿产资源”、“环境地质”、“地域地质”、“工程地质”和“科技信息”等研究室，以及 “实验测试中心”和 “青岛海洋地质工程勘察院”。其研究方向是： “以海洋区域地质调查研究为基础，以海洋油气地质及其他矿产地质和海洋地质环境变迁为重点，建立基础研究与应用基础研究并重的学科结构，以期在中国海域的区域地质、环境地质和矿产地质研究方面形成特色和优势，成为国家级的专业科研单位。”1979年至今，先后与荷兰、美国、澳大利亚、比利时、法国、苏联、韩国、日本、加拿大等国开展了科技合作与交流活动，并成功地为CCOP成员国举办了“第四纪沉积学及实验技术” 培训班和 “三角洲沉积作用讨论会”。该所已完成各类科研项目百余项，有57项获国家、部级和省、市科技成果奖。其中“中国海区及邻域地质地球物理系列图集”获国家自然科学二等奖，地矿部科技成果奖一等奖。
该所编辑出版《海洋地质与第四纪地质》、《海洋地质动态》、《海洋地质情报文集》、《海洋地质动态研究》等多种刊物，其中国内外公开发行的学报级刊物《海洋地质与第四纪地质》属中国300种自然科学核心期刊。